Doorlooptijd
10 werkdagen
48.4
40
DNA-test voor de URB1-variant c.5995del / haplotype LA2, een autosomaal recessieve semi-letale oorzaak van embryonale letaliteit en verminderde worpgrootte bij Landrasvarkens.
Overzicht
Deze DNA-test analyseert de URB1-variant c.5995del, gekoppeld aan haplotype LA2, bij het varken. Het ziektebeeld wordt benoemd als embryonale letaliteit, embryonale sterfte, spontane abortus, verminderde worpgrootte of URB1/LA2-gerelateerde reproductieverlies.
De variant is beschreven in Landrasvarkens. URB1 is betrokken bij ribosoombiogenese en celfuncties die essentieel zijn voor groei en embryonale ontwikkeling. De test is vooral relevant voor fokdieren, omdat dragers zelf normaal kunnen functioneren maar in combinatie met een andere drager embryo’s met twee variantkopieën kunnen voortbrengen.
Bij paringen tussen twee dragers kan ongeveer een kwart van de embryo’s twee kopieën van de variant erven. Voor URB1/LA2 werd bij drager-drager paringen een daling van het totaal aantal geboren biggen van ongeveer 15.9% beschreven ten opzichte van drager-vrije combinaties. Deze variant wordt als semi-letaal beschreven: homozygote dieren zijn sterk ondervertegenwoordigd en embryo-overleving is duidelijk verminderd.
Omdat het verlies meestal vroeg in de dracht optreedt, ziet men niet noodzakelijk meer doodgeboren of gemummificeerde biggen. Het probleem uit zich vooral als minder geboren biggen, terugkerende lege zeugen of reproductieresultaten die moeilijk te verklaren zijn zonder genetische informatie.
Dit kenmerk erft autosomaal recessief over. Een vrij dier heeft geen kopie van de geteste variant. Een drager heeft één kopie en kan de variant doorgeven zonder zelf aangedaan te zijn. Een homozygote combinatie met twee kopieën veroorzaakt embryonale letaliteit of sterk verminderde embryonale overleving.
De resultaatlabels voor deze test zijn N/N, N/del en del/del. De gerapporteerde status maakt duidelijk of het dier vrij is, drager is of twee kopieën van de geteste variant draagt.
Voor varkensfokkers is deze test waardevol omdat reproductieverlies door recessieve lethale allelen vaak verborgen blijft tot twee dragers gecombineerd worden. Door dragers tijdig te herkennen, kunnen fokcombinaties doelgericht gepland worden zonder waardevolle lijnen onnodig uit te sluiten.
Inbegrepen deelanalyses
Deze analyse omvat de volgende subanalyse:
Allelcombinaties en interpretaties
Hieronder vind je per onderzocht locus de mogelijke allelencombinaties die binnen deze analyse gerapporteerd kunnen worden, met telkens een korte toelichting van hun genetische betekenis. De interpretatie van mogelijke interacties tussen verschillende loci wordt op het rapport meegenomen, maar wordt hier niet volledig weergegeven omdat dat op deze pagina tot te veel combinaties zou leiden. De uiteindelijke uiting kan bovendien mee afhangen van andere genen en hun onderlinge interactie.
Genotype / allelencombinatie: Vrij (N/N)
De geteste URB1-variant / haplotype LA2 is niet aangetoond. Dit dier geeft deze variant niet door en kan voor deze variant veilig met een drager gecombineerd worden zonder homozygote lethale embryo’s te produceren.
Genotype / allelencombinatie: Drager (N/del)
Eén kopie van de geteste URB1-variant / haplotype LA2 is aangetoond. Dit dier is drager en kan de variant aan ongeveer de helft van zijn nakomelingen doorgeven. Combineer deze drager niet met een andere drager om homozygote lethale embryo’s en kleinere worpen te voorkomen.
Genotype / allelencombinatie: Letaal genotype (del/del)
Twee kopieën van de geteste URB1-variant zijn aangetoond. Dit genotype veroorzaakt ernstige embryonale overlevingsproblemen; homozygote dieren zijn sterk ondervertegenwoordigd en drager-drager combinaties geven duidelijk kleinere worpen.
Bemonstering en insturen







Referenties