Doorlooptijd
10 werkdagen
PCR-panel voor ASIP-varianten geassocieerd met agouti-locus vachtkleurfenotypes bij het konijn zoals tan/'black and tan'.
Overzicht
Het A-gen, ook bekend als het ASIP-gen (Agouti Signaling Protein), speelt een belangrijke rol in de bepaling van vachtpatronen. Dit gen volgt een dominantiehiërarchie, waarbij het A-allel dominant is en het a-allel recessief.
Er worden drie belangrijke allelen onderscheiden:
Inbegrepen deelanalyses
Deze analyse omvat de volgende deelanalyses:
Allelcombinaties en interpretaties
Hieronder vind je per onderzocht locus de mogelijke allelencombinaties die binnen deze analyse gerapporteerd kunnen worden, met telkens een korte toelichting van hun genetische betekenis. De interpretatie van mogelijke interacties tussen verschillende loci wordt op het rapport meegenomen, maar wordt hier niet volledig weergegeven omdat dat op deze pagina tot te veel combinaties zou leiden. De uiteindelijke uiting kan bovendien mee afhangen van andere genen en hun onderlinge interactie.
Allelencombinatie: A/A
Bij dit A-locus werden geen black and tan- of non-agouti-varianten aangetoond. Dit past met andere woorden bij agouti of wildkleur op dit locus. Dit dier kan via dit locus geen geteste a^t- of a-variant doorgeven. Het uiteindelijke vachtbeeld blijft wel mee afhangen van andere kleurgenen.
Allelencombinatie: A/a^t
Dit dier is drager van black and tan. Het kan het a^t-allel doorgeven aan nakomelingen. Omdat A dominant is, past dit op dit locus meestal nog bij agouti, maar het zichtbare kleurpatroon blijft mee afhangen van andere kleurgenen. Bij combinatie met een partner die ook a^t draagt of black and tan is, kunnen black and tan-nakomelingen vallen.
Allelencombinatie: a^t/a^t
Dit dier heeft het black and tan-genotype op het A-locus. Het geeft op dit locus altijd een a^t-allel door. Het zichtbare kleurpatroon kan nog beïnvloed worden door andere kleurgenen. Wie black and tan wil vermijden, combineert best alleen met een partner zonder a^t-variant.
Allelencombinatie: A/a
Dit dier is drager van non-agouti/self. Het kan het a-allel doorgeven aan nakomelingen. Omdat A dominant is, is het konijn meestal agouti (wildkleur), maar het zichtbare kleurpatroon blijft mee afhangen van andere kleurgenen. Bij combinatie met een partner die a draagt of non-agouti is, kunnen non-agouti-nakomelingen vallen.
Allelencombinatie: a^t/a
Dit dier draagt één a^t-allel en één a-allel en past op dit locus het best bij black and tan. Het kan aan nakomelingen a^t of a doorgeven. Het uiteindelijke kleurbeeld blijft mee afhangen van andere kleurgenen. Afhankelijk van de partner kunnen black and tan- of non-agouti-combinaties in de nakomelingen voorkomen.
Allelencombinatie: a/a
Dit dier heeft het non-agouti/self-genotype op het A-locus. Het geeft op dit locus altijd een a-allel door. Het uiteindelijke kleurbeeld blijft nog afhangen van andere kleurgenen die kleurintensiteit en tekening beïnvloeden. Bij combinatie met een partner die ook a draagt of non-agouti is, kunnen opnieuw non-agouti-nakomelingen vallen.
Bemonstering en insturen
De meest geschikte DNA-stalen zijn bloed of een droge wangswab. Andere stalen waar DNA in aanwezig is kunnen ook in aanmerking komen.
Neem het staal schoon af en vermijd contaminatie tussen dieren.
Voor swabs: laat volledig drogen voor verzending.
EDTA-buis voor volbloed; steriele droge swab.
Verzend droog en lekvrij verpakt. Bescherm tegen vocht, hitte en kruiscontaminatie. Voeg duidelijke identificatie per staal toe.
Referenties